Viele der geschützten Biotope bedürfen spezieller Pflege. Sofern sie sich nicht in einem ausgewiesenen Naturschutzgebiet befinden, ist der jeweilige Flächeneigentümer dafür verantwortlich. Viele dieser Biotope liegen auf Flächen der Berliner Forsten oder landeseigenen Flächen der Bezirke. Hier wird die Pflege in Kooperation mit den Naturschutzverwaltungen des Senats und der Bezirksämter sowie fachlicher Beratung durch den Landesbeauftragten für Naturschutz in Berlin durchgeführt.
Doch auch private Flächeneigentümer sind für die Erhaltung dieser Flächen verantwortlich. Viele wissen vermutlich gar nichts von den Schätzen auf ihren Grundstücken und den meisten fehlt das Fachwissen für die Pflege.