Der Programmplan Naturhaushalt und Umweltschutz will die natürlichen Ressourcen Klima, Luft, Boden und Wasser erhalten und Verbesserungen für die Schutzgüter Tiere, Pflanzen, biologische Vielfalt und den Menschen erzielen. Dazu weist er Vorsorgegebiete für die Naturgüter Klima, Wasser, Luft und Boden aus:
- Das Vorsorgegebiet Klima umfasst drei Räume, für die besonderer Handlungsbedarf besteht: bioklimatisch belastete Stadträume, Kaltluftbahnen und -abflüsse und die Berliner Wälder.
- Das Vorsorgegebiet Grundwasserschutz grenzt Gebiete ab, in denen Maßnahmen zum Schutz des Grundwassers getroffen werden müssen. Vorhandene oder geplante Nutzungen müssen sich hier an den Anforderungen für den Grundwasserschutz orientieren.
- Das Vorsorgegebiet Luftreinhaltung umfasst den Bereich der Stadt, in dem Maßnahmen vordringlich sind, die die Luft verbessern.
- Das Vorsorgegebiet Boden stellt Ziele und Maßnahmen für besonders wertvolle und unversiegelte Böden dar.
Neben den Maßnahmenbündeln für die Vorsorgegebiete benennt der Plan spezifische Anforderungen an Nutzungen, um die natürlichen Ressourcen zu schützen. Außerdem enthält er ortsbezogene Einzelmaßnahmen. Darstellungen, Entwicklungsziele und Maßnahmen sichern die Funktionsfähigkeit des Naturhaushalts und tragen unter anderem dazu bei, die Auswirkungen des Klimawandels auf die Stadt zu mindern, die natürlichen Bodenfunktionen und die natürlichen Lebensgrundlagen der Menschen zu verbessern und die Ziele der Wasserrahmenrichtlinie (WRRL) zu erreichen.