Die Geschäftsstelle mit Werkhalle und modernen Seminarräumen im Haus des Traditionsunternehmens Scheidt Maschinen- und Eisen KG wurde am 12.7.2006 in der Helmholtzstraße 13-14 eröffnet.
Die Projektagentur Domäne Dahlem wurde im September 2000 als gemeinnützige Gesellschaft zur Förderung von Bildung, Kultur und Umweltschutz mbH gegründet. Alleiniger Gesellschafter war bis 2007 der Verein Freunde der Domäne Dahlem e.V..
Aus der Domäne Dahlem Projektagentur ging im Jahr 2007 die Projektagentur hervor. Gesellschafter sind die derzeitigen Gechäftsführer.
Die Hauptgeschäftsstelle befindet sich in der Lahnstr. 17, 12055 Berlin.