Machen geht am besten mit Projekten. An Projekten wird Veränderung deutlich und im Stadtraum sichtbar. Die vergangenen Projekte waren zeitlich und thematisch begrenzt. So fiel es leichter, sich für ein Projekt zu engagieren und sichtbare Ergebnisse zu erzielen. Deswegen orientierte sich die Arbeit der Stadtwerkstatt an einer Vielzahl von Projekten.
Diese teils umfangreichen städtebaulichen Projekte für die Berliner Mitte wurden von verschiedenen Projektträgern umgesetzt und von den jeweils zuständigen Senatsverwaltungen in die Stadtwerkstatt eingebracht. Dabei waren jeweils unterschiedliche Beteiligungsspielräume vorhanden, die in den entsprechenden Veranstaltungen transparent kommuniziert wurden.