Die Unternehmer Cohn & Rosenberg ließen 1887 die Anlage unter dem Name “Humboldt-Mühle” zu einer leistungsstarken Großmühle ausbauen. Die Victoria-Mühlenwerke beteiligten sich 1924 an der Humboldtmühlen-AG und gliederten sie 1930 in ihr Unternehmen ein. Sie betrieben die Mühle bis zur Aufgabe des Betriebes 1988.
Die Gebäude der Mühlenanlage sind Zeugnis von fast einem Jahrhundert Berliner Bau- und Mühlengeschichte und stehen heute unter Denkmalschutz. Der technische Fortschritt mit der Einführung der Dampfkraft und Großbrände in den Jahren 1912 und 1939 erforderten den Neu- und Wiederaufbau eines großen Teils des Mühlenbetriebes in unterschiedlichen Zeiträumen.
Der Umbau für eine zeitgemäße Nutzung, unter Bewahrung der historischen Bausubstanz, wurde in den Jahren 1989-92 erfolgreich realisiert. Das Mühlengebäude (1912/13), der Getreidesilo (1939/40) und das Beamtenwohnhaus (1848) wurden restauriert, auf eindrucksvolle Weise mit neuer Architektur ergänzt. Seit Februar 2009 hat auf dem Gelände am Tegeler-Fließ der Medical Park Berlin Humboldtmühle seine Tore geöffnet.