Eine andere Arbeitsgemeinschaft der Merian-Schule widmet sich der Imkerei. Die fleißigen Schülerinnen und Schüler tun alles, damit es den Bienen gut geht. Sie kümmern sich um die Wintereinfütterung und die Königinnenzucht, schweißen Wachsplatten in Rähmchen und streichen die Beuten. Sie wissen nicht nur, was eine gute Bienenweide ausmacht, sondern können auch den Honig selbst ernten und kontrollieren. Um die Verarbeitung und Vermarktung von Honig und Bienenwachskerzen kümmert sich wiederum die Schülerfirma bee-Merian. Die Gewinne aus Imkerei und Schülerfirma fließen in den Erhalt und den Ausbau der Bienenhaltung oder gehen als Spende an ökologische Projekte der Schule – wie zum Beispiel die Schulgarten-AG.